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作者：Daisy
导读：如果患者感染的结核分枝杆菌对一种或一种以上的抗结核药物产生了耐药性，即为耐药结核病。现在，利用基因组测序技术，研究人员确定了13种最常见的结核药物治疗产生耐药性的基因组变异，确定了耐药性的遗传原因。研究人员收集了全球有史以来最大的结核分枝杆菌临床样本数据集，创造出迄今为止最全面的结核病耐药基因变化图谱。检测结核分枝杆菌基因组的突变以确定哪些药物能给患者提供最佳治愈机会。研究人员总共发了9篇预印本，通过这种创新的、大规模的、国际性的合作，旨在帮助改善对结核病的控制，通过基因耐药性预测，使得更好、更快和更有针对性地治疗耐药结核病，最终全基因组测序可能会取代普通药敏检测（DST）。
利用尖端基因组测序技术，牛津大学的研究人员已经确定了几乎所有使人们对13种最常见的结核（TB）药物治疗产生耐药性的基因组变异。
结核病综合耐药性预测国际联合会（CRyPTIC）研究项目收集了全球有史以来最大的结核分枝杆菌临床样本数据集，包括来自五大洲27个国家的个样本。
利用两项关键的进展：一项新的耐药性定量检测和一项识别耐药结核杆菌样本中所有基因变化的新方法，研究人员生成了一个独特的数据集。该团队使用该数据集，来量化结核分枝杆菌基因编码的变化如何降低不同药物杀死这些导致结核病的细菌的效果。这些创新，加上该领域正在进行的工作，有望在未来深刻改善结核病患者的治疗方式。
结核病是由结核杆菌感染引起的慢性传染病。结核菌可能侵入人体全身各种器官，但主要侵犯肺脏，称为肺结核病。结核病是青年人容易发生的一种慢性和缓发的传染病。潜伏期4～8周。其中80%发生在肺部，其他部位（颈淋巴、脑膜、腹膜、肠、皮肤、骨骼）也可继发感染。人与人之间呼吸道传播是本病传染的主要方式。传染源是接触排菌的肺结核患者。随着环境污染和艾滋病的传播，结核病发病率越发强烈。除少数发病急促外，临床上多呈慢性过程。常有低热、乏力等全身症状和咳嗽、咯血等呼吸系统表现。
除了SARS-CoV-2之外，结核病每年致死的人数比任何其他细菌、病*或寄生虫都多。尽管它是可以治疗的，但耐药性在过去三十年中已经成为一个主要问题。检测结核分枝杆菌基因组的突变以确定哪些药物能给患者提供最佳治愈机会，是对每一位需要的患者进行耐药性检测的最现实的方法。
牛津大学微生物学教授DerrickCrook博士说：“这种创新的、大规模的、国际性的合作，使我们能够创造出迄今为止最全面的结核病耐药基因变化图谱。”
在一系列九份新的预印本手稿中，研究人员揭示，每一份手稿都记录了CRyPTIC项目如何推进该领域的不同方面：
1.新的耐药性检测应该如何解释，以及一个大规模的公民科学项目如何帮助解决这个问题的。
2.一种检测和描述结核病全基因组序列中基因变化的新方法是如何改进了检测导致耐药性的基因变化的方法。
3.如何利用这些数据扫描结核病基因组序列，寻找以前未知的导致耐药性的变化。
4.个体突变和突变组合不仅与“耐药性”或“易感性”有关，还与药物杀死结核分枝杆菌的微小变化有关，从而降低治疗效果，特别注意用于治疗结核的两种新化合物。
5.人工智能如何根据DNA序列中的特征预测耐药性。
6.这些数据是如何促成世界卫生组织批准全球使用的第一份结核病基因组耐药突变列表的。
这些结果旨在帮助改善对结核病的控制，并通过基因耐药性预测更好、更快和更有针对性地治疗耐药结核病，促进世界卫生组织的终结结核病战略，为普遍药敏检测(DST)铺平道路。
Crook教授说：“我们的最终目标，是实现对大多数抗结核药物耐药性的足够准确的基因预测，以便全基因组测序可以取代结核病的基于培养的结核病DST。这将使接近患者的检测快速转变，从而彻底改变耐多药结核病的鉴定和管理。”
这些数据，现在可以免费获得，可以被更广泛的科学界用来提高我们对结核病耐药性的理解，以及如何最好地治疗这一重要疾病。
参考资料：